舞台是关西一架空都市。留有这个国家的浓厚传统和历史的城市，『夹都市（きょうとし）』。
「想活下去啊……」
「是吗。那么你的祈求——确实，已经传达到了」
与此句话同时，自称“神”的少女，将手上的剑刺穿了我的身体。
——究极超S的高天原之女王，天照大神（アマテラス）
——肌肤超敏感很容易有感觉的武神，建御雷神（タケミカズチ）
——天然又色色的露出狂，天钿女命（アメノウズメ）
在这个城市被传得煞有其事似的“神”与“怪异”的目击之谈。
在正调查那传闻的真相的我面前出现的是，有着脱轨性格的三柱女神。
被牵连似的——或者应该说是自己跳进火坑的。
被赋予战斗能力的我要与她们一起，追寻着在这个城市里出现各式神灵们所引发的各类事件。
所谓的神灵是，所谓的信仰是，还有——人类到底是什么呢。
然后逐渐清楚起来的，事件的背后。重叠在一起的真实。
在现代编织而成，新的神话解说和人的祈祷的故事。