有一种被称为“傀儡（くぐつ）”的人偶。
它们潜藏在人类的社会，在暗处掌控着世界的历史。
但是，没有人知道是谁出于什么目的制造这些人偶，是谁的意志让人偶活动……

主人公羽白光奈（はじろ みな），是个随处可见的高中1年级女生。
最近的习惯是走进她所喜欢的人偶馆。
为了去看放置在人偶馆深处的、被称为“瑠枷（るか）”的漂亮人偶，光奈频繁地踏足这间人偶馆。
——突然有一天，光奈的世界发生了剧变。
她拥有了能够目测潜藏在人世间非人“傀儡”的能力。
实际上瑠枷是拥有被称为是能够左右世界的未来的力量的、名为“ミマ”的存在，通过与瑠枷的契约（共鸣），光奈获得了目测、破坏“傀儡”的能力。

光奈的力量觉醒后，她被强制加入了破坏（暗杀）潜藏在人类世界的“傀儡”的组织。
只想作为普通的高中生而生活的光奈对如此蛮横的行为作出了反抗，然而她的意志无法影响现实，“傀儡”还是出现在她的生活之中。

与光奈同属的组织成员中，有年纪虽小却拥有天才头脑的小学生ジェシカ，
隶属于华侨财阀的妖艳美女楊麗鈴（ヤン・レイリン），
还有就读于同一所高中的統神璃子（すめらみ りこ）。
光奈与她们一起跟“傀儡”战斗，期间她们的伙伴关系不断加深。
然后，随着与神秘美女高千穂紗代（たかちほ さよ）的接触，以及好友相沢真琴（あいざわ まこと）被事件牵连，事态发生了剧变。

难道这，就是傀儡与人类的战斗吗？
光奈在为自己的命运感到困惑之际展开了战斗——