位于日本西南方向、偏远的四季如夏的孤岛・月読島（つくよみじま）。
主人公芳乃零二（よしの れいじ），是个住在岛上的普通的学生——“原本”。
有一个美丽的少女，救了突然陷入超乎常理的困境的零二。
她正是『No.13（ミッシングナンバー・サーティーン）』、由古代流传下来的传说中的“戦略破壊魔術兵器”——
俗称『魔法』的超科学兵器。

『戦略破壊魔術兵器（魔法）』的形状能够体现出拥有者的形象，被给予其独一无二的特殊“能力（チカラ）”。
然而，他所能使用的两种“能力（チカラ）”——
却是「召唤24小时之内所遇见的人」，
以及「让物质恢复24小时前的状态」这样与兵器和战斗风马牛不相及的能力。

然后与追求和平生活的零二的想法相反，他被卷进了赌上了重要东西的13人的『被召唤者（魔法使）』之间的战斗之中。

在月読島轮回重复的『超能力者（魔法使）』之间的悲哀的战斗的宿命（连锁）。
他的赌注，就是他想守护的对他极其重要的日常生活、青涩的青春校园生活。
为了切断犹如da capo一般的斗争命运，零二今天也在战斗的漩涡中奋进——
觉醒后：
因为性命的危机而觉醒的、最后的『召喚せし者（マホウツカイ）』
———『No．13（ミッシングナンバー・サーティーン）』———
因为觉醒不久，魔术的知识差不多等于零，但是从自律思考型的サクラ那里获得了知识，以此来弥补自己不足的经验。
毫无战斗经验，但因为习惯了与武术全能的龍一之间的打架，对某些人的“战斗”适应能力很高。
另外其潜在的魔力量远超别人，在超越凡人的『召喚せし者』们眼中，也是个很特别的“イレギュラー”。
作为『召喚せし者』，他的“能力”看上去跟战斗没什么联系，但是他既能召唤同伴又能修复受了伤的身体，作为战斗辅助型来说是优秀的能力。

「如果这是赌上各自的存在的战斗的话——用拳头决胜到最后的才称得上是男人吧」