御代街（みしろまち）——这是一个随着都市开发计划而急速发展的城镇。
从很久以前这个城镇就是由土地神和精灵所守护着的，这样的传说也渐渐成为过去的故事而已了。
时至今日，还会继承这信仰的人，已经所剩无几。

尽管如此，10年一度的土地神祭依旧是万人空巷的盛大活动。
在御鷹ヶ丘学園（みたかがおかがくえん）上学的主人公瀬川彰人，由于那自古留传下来的血统，即将在祭典时担任神官。
而且，为了守护土地神，必需选出一名巫女，而这一次的巫女将会是青梅竹马的捺菜，对此彰人不禁雀跃，说不定这会成为一次特别的祭典。

然而，就在为了准备祭典而充满朝气的城镇上，仿佛小孩子的恶作剧般，无法解释的事件开始频频发生。
很快地，不可思议的谣言开始在大街小巷传开。

「我看到不可思议的生物了！」

当然，对于那样的谣言，彰人并不相信，可是某一天，他还是看到了，那绝不可能存在的奇妙生物。

「真的能看到呀。」

那是因城镇开发而失去住所，不知该往哪去的精灵们，捺菜如是说。
带着一头雾水的彰人，她把精灵送回了森林深处，那是普通人因结界而无法踏足的禁地。
就是在那里，彰人和自古以来就住在这里，美得百般难描的土地神——涼相遇了。

和她的接触，让彰人下定决心：势必保护迷失到城镇的精灵们，将它们安全送回森林。
人类，以及超越人类的存在所上演的，这一出永恒的“羁绊相系的故事”就此拉开了序幕。